新发地病毒来自欧洲？专家：通过冷链传播的可能性最大
@中国新闻网
自6月11日以来，北京市新增新冠肺炎累计确诊病例中，绝大多数都与新发地农产品批发市场有关。目前，新发地市场所在地丰台区花乡地区被列入全国唯一疫情高风险地区，另有北京市四个区10个街乡位列中风险地区。
眼下，病毒溯源与排查潜在感染者是北京这波疫情防控的两大重要任务。
溯源问题初明
记者6月14日下午再次来到新发地批发市场附近，发现整个市场已被封锁，众多警务人员密集把守。这次突如其来的病毒究竟来自何方引人关注。
“通过全基因组测序发现病毒是从欧洲方向来的，初步判定与输入性有关。但病毒到底怎么来的，还无法确定。有可能是污染的海产品或肉类，或者进入市场的人通过分泌物进行传播。”北京市疾控中心新冠肺炎疫情防控专家组成员杨鹏接受央视新闻采访时表示，溯源工作还在进一步开展过程中。
杨鹏分析说，在短时间内出现这么多病例，人与人之间传播的可能性非常大，但并不能排除物品污染、共同暴露导致传播的可能性。
中国疾控中心流行病学首席专家吴尊友在媒体上介绍说，研究人员日常采集带有病毒的生物样本也通过低温保存，温度越低，病毒存活时间越长。批发市场中很多海产品是冷冻储存的，这样的环境下，病毒更容易存活，传染人的几率比较大。
“北京之前已经五十多天没有新增病例了, 这次肯定是输入性的。” 香港大学新发传染性疾病国家重点实验室主任以及流感研究中心主任管轶分析说，冷链传播或进入市场的人造成传播，这两种可能性都存在。“这么大范围的调查需要时间，他们也是连续三十多个小时没休息，相信会有结果。”管轶说。
管轶认为，可以根据目前已知阳性病例和确诊患者的上下游接触网建立一个模型，追溯传播源头，同时，更为关键的是在新发地市场检测出的阳性环境样本。报道中的三文鱼案板不是唯一的阳性样本，把所有的阳性环境样本作为另一个线索，进行上下游排查，这些线索是否有交叉点、所携带病毒是否一致。目前全球公开的新冠病毒序列大约有200个，研究病毒的基因序列和哪个地区的病毒相近，就知道来源了。“通过冷链传播进来的可能性最大，欧美很多屠宰场都暴发了新冠疫情，如果真的经由冷链传播，并不是新鲜事。”管轶说。
据路透社报道,两名美国官员6月8日称,美国“西奥多•罗斯福”号航空母舰上60%船员的新冠病毒抗体检测结果为阳性。“航母在太平洋上，几个月不靠岸，也出现了新冠感染，冷链传播的可能性非常大。”管轶分析说。
香港大学病毒学专家、医学教授金冬雁表示，新冠病毒有三万个核苷酸，在一个人传给另一个人以后，尽管新冠病毒的变异概率很小，但很多情况下核苷酸会变几个，因此一个病毒的基因序列测出来后，放在基因族谱中比较，跟谁最像就能知道它的来源。
目前，这个测序结果来自多少个样本并不清楚，不过，金冬雁分析，从目前北京疫情的流行病学特点来看，这是一个聚集性的感染，而且时间先后比较接近，也就是说，一个来源传给多人的可能性比较大，因此基因序列应该是很相像的，即便是一个样本的基因序列结果，也比较有代表性。
大数据找寻密接，未来两到三周是疫情发展关键期
6月11日出现的首发病例家住北京市西城区月坛街道西便门东大街。6月13日晚，记者到患者所在西便门社区，门卫表示，“近两天至少5个人被接去大兴隔离，其中1人是社区居委会工作人员，隔离两周。”
6月14日上午，北京市政府新闻发布会称，前一天新增36例确诊病例，且都与新发地市场有关，而这36例绝大多数由前一天的46例无症状感染者转归而成。
国家CDC某不愿具名的流行病专家称，病例通报的增幅并不代表病例每日实际的新发数量。事实上，这正说明北京市在积极排查潜在的传染源、密切接触者，北京正在做这一项工作，这是阻断疾病进一步传播非常有效的手段。
眼下，北京正在加班加点的进行核酸检测，来排查所有可能潜在的感染者。一些媒体拍摄的视频显示，在丰台体育中心体育场、宣武体育场等开阔露天场所，数以千计的近期内去过新发地市场的各区市民在天黑之后仍在排队接受核酸检测。
根据6月14日下午北京市的最新通报，围绕新发地有关人员和环境开展核酸检测工作，已共采集人员样本8186件，截至目前，5803份咽拭子样本已完成检测，均为阴性。拟对周边小区4.6万名居民全部进行核酸检测，共设置核酸检测站点24个，目前全区已检测10881人。
管轶说，从6月11日通报第一例新增本土病例到13日鉴定出新发地，又将新发地污染的食物、人员检测出来，“这是一个蛮大的进步，顺着这条线继续筛查，我相信，在新发地的取样不是一两千份，可能会有上万份。”
北京大学第一医院呼吸和危重症医学科主任王广发称，像这样病例散发或者局部性暴发在未来可能还会不时出现。目前要做的是对确诊病例进行进一步分析，明确这些病例到底是在新发地先后感染的，还是一代传二代，二代传三代，要进一步明晰传染链条。而现在是否已经找到了所有传染源，有没有遗漏，也值得思考。
月坛街道西便门东大街一位“被动隔离”的居民是此次首发患者的邻居。他的妻子回忆，6月12日早上9点多接到电话通知，前一天晚上8点做的核算检测和血清抗体检测都是阴性，但社区传达疾控的通知，根据大数据算法，她的丈夫属于密切接触者。下午4点多，救护车把密接居民接走了，一人一辆救护车。开车进入大兴隔离点后，被安排住进标准三人间，实际1个人住，带手环实时监测体温。13日下午又做了一次咽拭子，估计这几天还会再做检查，密切监督。
这两天，关于运用微信和支付宝支付大数据锁定密切人员的信息在网上热传，相关信息称，依靠大数据共锁定了包含35万人的名单。但支付宝官方微博6月14日晚回应称，支付宝没有提供过相关数据，疫情相关信息请以卫生防疫部门官方发布为准。
北京市西城区德胜社区卫生服务中心工作人员解释说，密切接触者是通过手机轨迹大数据计算得出的，例如手机定位显示，在某个时间段同时出现在电梯或楼道的某个区域。
新发地市场人流复杂，且市场面向全北京供应蔬菜、肉类，此次疫情暴发是否会超越此前黑龙江哈尔滨市或吉林舒兰市的规模？管轶认为，“把46例阳性患者过去1周或5天的运行轨迹、接触网确定下来，这个传染范围就有基本答案了。但是这些患者接触的人或物有没有被污染、是否有传染性，现在还没有量化，任何人给的答案都是模棱两可，这是一个科学问题。”管轶说。
北京这场疫情能持续多久，会有多大规模，王广发认为，这要看未来两周内疫情的发展态势，这是病毒的一个潜伏期，如果病例数在后面的日子中逐渐减少，意味着疫情将逐步得以控制。
北京疫情影响全国 多地出台防控措施
北京市的这次疫情在全国产生了涟漪效应。6月13日和14日，河北迁安市、内蒙古通辽、天津滨海新区、黑龙江哈尔滨等地疾控中心相继发出提醒和公告，对从北京到本地的人员作出相应要求。有北京市民表示，自己本来正在外地出差，却被当地通知需要立即集中隔离。还有人因来京出差，在返回之际却被告知回去后要隔离14天，因此滞留在京。很多北京市民原本定好了端午假期的国内出行计划，都因此次疫情而取消
在沈阳桃仙国际机场，根据辽宁省疫情管控最新措施，2020年6月13日20：00起，对从北京市丰台区，西城区月坛街道，房山区长阳镇来辽人员采取14天集中隔离管控措施。
哈尔滨市12320卫生热线工作人员表示，该市目前要求北京市所有区域来哈人员一律进行至少24小时的集中隔离并接受两次核酸检测。核酸检测结果为阴性并在哈有固定住所的，在集中隔离解除后需要再进行居家隔离7天；核酸检测结果为阴性但在哈无固定住所、不具备居家隔离条件的，需要继续集中隔离7天。该工作人员透露，防控措施可能会更加严格，有统一集中隔离14天的趋势。
大庆市卫健委工作人员则称，北京市中、高风险地区所在的丰台区、西城区和房山区来庆人员需集中隔离14天并接受核酸检测，集中隔离结束后还需要再进行14天的居家隔离，具体防控措施以目的地所在的区县要求为准，内蒙古通辽也执行类似的规定。
国家卫健委6月14日指出，目前北京疫情防控形势依然十分严峻，疫情防控工作仍然存在不确定性。要切实落实“外防输入、内防反弹”的防控策略，健全及时发现、快速处置、精准管控、有效救治的常态化防控工作，尽快查清传染源，有效阻断传播途径，坚决遏制疫情蔓延扩散。
（来源：中国新闻周刊）
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自6月11日以来，北京市新增新冠肺炎累计确诊病例中，绝大多数都与新发地农产品批发市场有关。目前，新发地市场所在地丰台区花乡地区被列入全国唯一疫情高风险地区，另有北京市四个区10个街乡位列中风险地区。
眼下，病毒溯源与排查潜在感染者是北京这波疫情防控的两大重要任务。
溯源问题初明
记者6月14日下午再次来到新发地批发市场附近，发现整个市场已被封锁，众多警务人员密集把守。这次突如其来的病毒究竟来自何方引人关注。
“通过全基因组测序发现病毒是从欧洲方向来的，初步判定与输入性有关。但病毒到底怎么来的，还无法确定。有可能是污染的海产品或肉类，或者进入市场的人通过分泌物进行传播。”北京市疾控中心新冠肺炎疫情防控专家组成员杨鹏接受央视新闻采访时表示，溯源工作还在进一步开展过程中。
杨鹏分析说，在短时间内出现这么多病例，人与人之间传播的可能性非常大，但并不能排除物品污染、共同暴露导致传播的可能性。
中国疾控中心流行病学首席专家吴尊友在媒体上介绍说，研究人员日常采集带有病毒的生物样本也通过低温保存，温度越低，病毒存活时间越长。批发市场中很多海产品是冷冻储存的，这样的环境下，病毒更容易存活，传染人的几率比较大。
“北京之前已经五十多天没有新增病例了, 这次肯定是输入性的。” 香港大学新发传染性疾病国家重点实验室主任以及流感研究中心主任管轶分析说，冷链传播或进入市场的人造成传播，这两种可能性都存在。“这么大范围的调查需要时间，他们也是连续三十多个小时没休息，相信会有结果。”管轶说。
管轶认为，可以根据目前已知阳性病例和确诊患者的上下游接触网建立一个模型，追溯传播源头，同时，更为关键的是在新发地市场检测出的阳性环境样本。报道中的三文鱼案板不是唯一的阳性样本，把所有的阳性环境样本作为另一个线索，进行上下游排查，这些线索是否有交叉点、所携带病毒是否一致。目前全球公开的新冠病毒序列大约有200个，研究病毒的基因序列和哪个地区的病毒相近，就知道来源了。“通过冷链传播进来的可能性最大，欧美很多屠宰场都暴发了新冠疫情，如果真的经由冷链传播，并不是新鲜事。”管轶说。
据路透社报道,两名美国官员6月8日称,美国“西奥多•罗斯福”号航空母舰上60%船员的新冠病毒抗体检测结果为阳性。“航母在太平洋上，几个月不靠岸，也出现了新冠感染，冷链传播的可能性非常大。”管轶分析说。
香港大学病毒学专家、医学教授金冬雁表示，新冠病毒有三万个核苷酸，在一个人传给另一个人以后，尽管新冠病毒的变异概率很小，但很多情况下核苷酸会变几个，因此一个病毒的基因序列测出来后，放在基因族谱中比较，跟谁最像就能知道它的来源。
目前，这个测序结果来自多少个样本并不清楚，不过，金冬雁分析，从目前北京疫情的流行病学特点来看，这是一个聚集性的感染，而且时间先后比较接近，也就是说，一个来源传给多人的可能性比较大，因此基因序列应该是很相像的，即便是一个样本的基因序列结果，也比较有代表性。
大数据找寻密接，未来两到三周是疫情发展关键期
6月11日出现的首发病例家住北京市西城区月坛街道西便门东大街。6月13日晚，记者到患者所在西便门社区，门卫表示，“近两天至少5个人被接去大兴隔离，其中1人是社区居委会工作人员，隔离两周。”
6月14日上午，北京市政府新闻发布会称，前一天新增36例确诊病例，且都与新发地市场有关，而这36例绝大多数由前一天的46例无症状感染者转归而成。
国家CDC某不愿具名的流行病专家称，病例通报的增幅并不代表病例每日实际的新发数量。事实上，这正说明北京市在积极排查潜在的传染源、密切接触者，北京正在做这一项工作，这是阻断疾病进一步传播非常有效的手段。
眼下，北京正在加班加点的进行核酸检测，来排查所有可能潜在的感染者。一些媒体拍摄的视频显示，在丰台体育中心体育场、宣武体育场等开阔露天场所，数以千计的近期内去过新发地市场的各区市民在天黑之后仍在排队接受核酸检测。
根据6月14日下午北京市的最新通报，围绕新发地有关人员和环境开展核酸检测工作，已共采集人员样本8186件，截至目前，5803份咽拭子样本已完成检测，均为阴性。拟对周边小区4.6万名居民全部进行核酸检测，共设置核酸检测站点24个，目前全区已检测10881人。
管轶说，从6月11日通报第一例新增本土病例到13日鉴定出新发地，又将新发地污染的食物、人员检测出来，“这是一个蛮大的进步，顺着这条线继续筛查，我相信，在新发地的取样不是一两千份，可能会有上万份。”
北京大学第一医院呼吸和危重症医学科主任王广发称，像这样病例散发或者局部性暴发在未来可能还会不时出现。目前要做的是对确诊病例进行进一步分析，明确这些病例到底是在新发地先后感染的，还是一代传二代，二代传三代，要进一步明晰传染链条。而现在是否已经找到了所有传染源，有没有遗漏，也值得思考。
月坛街道西便门东大街一位“被动隔离”的居民是此次首发患者的邻居。他的妻子回忆，6月12日早上9点多接到电话通知，前一天晚上8点做的核算检测和血清抗体检测都是阴性，但社区传达疾控的通知，根据大数据算法，她的丈夫属于密切接触者。下午4点多，救护车把密接居民接走了，一人一辆救护车。开车进入大兴隔离点后，被安排住进标准三人间，实际1个人住，带手环实时监测体温。13日下午又做了一次咽拭子，估计这几天还会再做检查，密切监督。
这两天，关于运用微信和支付宝支付大数据锁定密切人员的信息在网上热传，相关信息称，依靠大数据共锁定了包含35万人的名单。但支付宝官方微博6月14日晚回应称，支付宝没有提供过相关数据，疫情相关信息请以卫生防疫部门官方发布为准。
北京市西城区德胜社区卫生服务中心工作人员解释说，密切接触者是通过手机轨迹大数据计算得出的，例如手机定位显示，在某个时间段同时出现在电梯或楼道的某个区域。
新发地市场人流复杂，且市场面向全北京供应蔬菜、肉类，此次疫情暴发是否会超越此前黑龙江哈尔滨市或吉林舒兰市的规模？管轶认为，“把46例阳性患者过去1周或5天的运行轨迹、接触网确定下来，这个传染范围就有基本答案了。但是这些患者接触的人或物有没有被污染、是否有传染性，现在还没有量化，任何人给的答案都是模棱两可，这是一个科学问题。”管轶说。
北京这场疫情能持续多久，会有多大规模，王广发认为，这要看未来两周内疫情的发展态势，这是病毒的一个潜伏期，如果病例数在后面的日子中逐渐减少，意味着疫情将逐步得以控制。
北京疫情影响全国 多地出台防控措施
北京市的这次疫情在全国产生了涟漪效应。6月13日和14日，河北迁安市、内蒙古通辽、天津滨海新区、黑龙江哈尔滨等地疾控中心相继发出提醒和公告，对从北京到本地的人员作出相应要求。有北京市民表示，自己本来正在外地出差，却被当地通知需要立即集中隔离。还有人因来京出差，在返回之际却被告知回去后要隔离14天，因此滞留在京。很多北京市民原本定好了端午假期的国内出行计划，都因此次疫情而取消
在沈阳桃仙国际机场，根据辽宁省疫情管控最新措施，2020年6月13日20：00起，对从北京市丰台区，西城区月坛街道，房山区长阳镇来辽人员采取14天集中隔离管控措施。
哈尔滨市12320卫生热线工作人员表示，该市目前要求北京市所有区域来哈人员一律进行至少24小时的集中隔离并接受两次核酸检测。核酸检测结果为阴性并在哈有固定住所的，在集中隔离解除后需要再进行居家隔离7天；核酸检测结果为阴性但在哈无固定住所、不具备居家隔离条件的，需要继续集中隔离7天。该工作人员透露，防控措施可能会更加严格，有统一集中隔离14天的趋势。
大庆市卫健委工作人员则称，北京市中、高风险地区所在的丰台区、西城区和房山区来庆人员需集中隔离14天并接受核酸检测，集中隔离结束后还需要再进行14天的居家隔离，具体防控措施以目的地所在的区县要求为准，内蒙古通辽也执行类似的规定。
国家卫健委6月14日指出，目前北京疫情防控形势依然十分严峻，疫情防控工作仍然存在不确定性。要切实落实“外防输入、内防反弹”的防控策略，健全及时发现、快速处置、精准管控、有效救治的常态化防控工作，尽快查清传染源，有效阻断传播途径，坚决遏制疫情蔓延扩散。
（来源：中国新闻周刊）
光阴十载，岁月流光。封剑于外，敛心于内。——记十年岁月自思量。
曾经以为，下个路口，还会有你。
直到现在，才开始不安，前路茫茫，你在何方？
时间冲淡了很多，我的心却依旧执着。
执着着，利用所有已知的手段得到你的消息。
而你，却了无音讯。
曾多次劝自己放下，
但自己又何曾放下。
就像那句话说的：
I like you, but just like you.
纵然万劫不复，
纵然相思入骨，
我也待你眉眼如初，
岁月如故。 https://t.cn/RD4C3n3
曾经以为，下个路口，还会有你。
直到现在，才开始不安，前路茫茫，你在何方？
时间冲淡了很多，我的心却依旧执着。
执着着，利用所有已知的手段得到你的消息。
而你，却了无音讯。
曾多次劝自己放下，
但自己又何曾放下。
就像那句话说的：
I like you, but just like you.
纵然万劫不复，
纵然相思入骨，
我也待你眉眼如初，
岁月如故。 https://t.cn/RD4C3n3
起底RNA，跑龙套还是暗黑教主？
2018-09-28 07:40:05 来源: 科技日报 作者: 本报记者 张佳星
9月20日，一篇“新研究挑战分子生物学中心法则”的报道表示，发表在《科学》杂志上的新研究表明，RNA在DNA修复过程中短暂现身，随后隐退。这一发现被认为是RNA在DNA“失能”时，主持生命密码的传递工作。
然而，在1957年，英国科学家弗朗西斯·克里克在学术会议讲座最先提出“中心法则”时，RNA还未入得人眼。中心法则是分子生物学中的教条、准则，高度概括出遗传信息的传递规律。
据文献记载，中心法则开篇时介绍道，“遗传物质的主要功能是控制（不一定直接）蛋白质的合成”，关注点聚焦于主要遗传物质DNA，以及最终产物蛋白质，只在“不一定直接”中表达了对RNA作用的猜测。因此随后几十年，人们先入为主地将RNA的作用理解为“跑龙套”。
在不久前，香山科学会议召开主题为“核糖核酸与生命调控及健康”的第632次学术讨论会，美国加州大学圣地亚哥分校教授付向东在会上表示，随着大量非编码RNA被发现，人们逐渐意识到RNA在生命活动中的作用被低估了，“蛋白质能干的事情，RNA基本都能干。”他连用几个“puzzle（谜）”总结RNA在生物学中的未知。
“暗黑教主”蕴藏多大暗能量？
浩瀚如海的非编码RNA仍有无数未知
2010年，《科学》杂志评选出本世纪前10年的十大科学成就。其中第一个就是“黑暗”基因组。《科学》给出的理由是，之前基因常常会得到所有的荣耀。但现在研究人员认识到，编码蛋白质的基因区域仅占整个基因组中的1.5%，而其余的基因组部分，包括长短不一的非编码核糖核酸（RNA）基因过去曾被当作“垃圾”，现在被证明它们与其他的基因同样重要。
数目巨大、种类繁多是非编码RNA的特点之一。人们至今还难以摸准它的脾气，例如，相关研究表明，相似序列的RNA，从密码结构上看可以认为是相同的，但翻译（信使RNA在细胞质里的核糖体上指导合成蛋白质的过程）的效率却大相径庭。
而无处不在则是它的另一个显著特点。这不仅体现在它大量存在于细胞内的各个细胞器中，还体现在它时刻在刷着“存在感”。它能量巨大，现已确认，非编码RNA参与了包括从干细胞维持、胚胎发育、细胞分化、凋亡、代谢、信号传导、感染以及免疫应答等几乎所有生理或病理过程的调控。
然而，从人类基因组计划提出到完成，耗时近20年，人们仅仅解密了占整个基因组1.5%的约两万个基因，虽然随着技术手段的不断进步，解密效率大幅提高，但浩瀚如海的非编码序列所扮演的“角色”，对于人类来说仍然有无数个谜团。
近年的研究表明，占人类基因组97%的非编码序列具有重要的生物学功能，且与人类的疾病相关。“但我们对这些非编码序列的了解只是‘冰山一角’。”中国科学院院士、中国科学院生物物理研究所核酸生物学重点实验室研究员陈润生表示，目前，人类对人类基因组绝大部分序列的功能还是未知状态。
近九成RNA留在核里做什么？
曾被忽略的细胞核依然是研究的“黑洞”
那么非编码RNA的真面目究竟如何呢？陈润生的团队从源头开始摸索：问题最终聚焦于中心法则指挥棒下，DNA转录为RNA后，“命运”最终走向了何方。为了对整体的遗传信息做一个梳理，他们用生物信息学方法追踪了所有RNA的去处。
研究结果表明，同样的RNA“人设”，实际存在4种“命运”。陈润生介绍，一种情况RNA是命运终点，不再发展；二是只有一小段翻译；三是按照经典的中心法则“按部就班”地翻译；四是过度翻译，就是可以对一段RNA循环翻译几个来回，形成一个蛋白质。
那么这些“命运”都出现在哪些“剧情”中呢？以RNA作为命运终结的那一支为例，陈润生团队以海拉细胞系为研究对象，发现由DNA转录为RNA后，89%的RNA并不走出细胞核。“这是出乎预料的，它们转录出来却并不走出细胞核，留在核里做什么呢？”陈润生表示，新的发现带来的是更大的未知。
细胞核中居然留存了将近九成的RNA，生命为什么会在进化中留下这样的机制？对于过去近百年始终把目光聚焦于细胞质的生命科学学者来说，细胞核中发生的一切宛如“黑洞”，目前仍无法想象。
“过去在中心法则的主导下，细胞质被认为是主要场所，而实际上囿于核中的非编码RNA的生物学作用、结构等迄今为止还远远没有破译。”陈润生说，目前学界虽然已经开始意识到非编码RNA并非“垃圾”，但相关研究方法仍是基于细胞质为主要场所，而对细胞核内的RNA是什么样的反应体系、什么样的结构还知之甚少。
超保守序列为何“亘古不变”？
非编码RNA之外或许还有更多谜题
一条长链条的非编码RNA，在一些情况下会只进行局部的翻译，生成小肽（蛋白质片段）。而大量的研究表明这个非编码RNA本身和它翻译出来的小肽，都具有明显的生物学功能，而且它们的生物学功能并不一致。
也就是说，对于生命这个超大型的机器来说，有的“小螺丝钉”表现出“一托二”甚至“一托多”的功能。
“我们在这方面也进行了梳理工作。”陈润生介绍，通过非编码RNA找到了100多个小肽，并统计这些翻译成为蛋白片段的生命活动是如何启动的。结果也出乎研究人员预料，大量的启动密码子与中心法则中的精细调控部分中提到的负责启动的密码子并不一致，但这种翻译并非随机，而是受调控的。进一步的调控研究仍在推进中。
陈润生认为，在编码区之外可能存在量级在20万左右的转录本（转录是指遗传信息从DNA转移到RNA，在RNA聚合酶的作用下形成一条与DNA碱基序列互补的信使RNA的过程。信使RNA携带遗传信息，能指导蛋白质合成。转录本则是由一条DNA通过转录形成的一种或多种成熟的信使RNA），现在充分研究的大约有三四千个左右。
“人类研究视野触及到的应该只占基因组的一半。另外一半中，也许有新的东西可能去开展新的探索。”陈润生提出未来可能的研究方向。他举例道，在生物进化的研究中，发现有200—300个碱基长度的超保守序列保守到一个碱基都不差，但它们中有一些没有任何转录RNA、也不存在于任何的调控区。这些超保守序列目前没有任何功能的线索，是什么让它们至关重要到不能够出现一丝一毫的差错和变化呢？陈润生认为，从这些无解的现象入手，可能找到突破现有理论体系的创新。
实际上，对于这些超保守序列的任何操作，包括基因敲除、基因编辑等，目前并没有证明产生哪方面的生命活动的变化。这些保守序列就如同站在智利复活节岛上的石像般展现出亘古不变的气质。
“在我们的基因组当中，在已经发现的现象之外，也许隐含着大量的不被人们轻易察觉的现象。”陈润生表示，RNA的巨大潜能是已知的未知之一，而或许还存在着组合、结构等未知的巨大机制并未进入人们的视野。
相关链接
中心法则的4个简明内容
①从DNA流向DNA（DNA自我复制）；
②从DNA流向RNA，进而流向蛋白质（转录和翻译）；
③从RNA流向RNA（RNA自我复制)；
④从RNA流向DNA（逆转录）
注：其中前两条是中心法则的主要体现，后两条是中心法则的完善和补充。
视觉中国（图）
2018-09-28 07:40:05 来源: 科技日报 作者: 本报记者 张佳星
9月20日，一篇“新研究挑战分子生物学中心法则”的报道表示，发表在《科学》杂志上的新研究表明，RNA在DNA修复过程中短暂现身，随后隐退。这一发现被认为是RNA在DNA“失能”时，主持生命密码的传递工作。
然而，在1957年，英国科学家弗朗西斯·克里克在学术会议讲座最先提出“中心法则”时，RNA还未入得人眼。中心法则是分子生物学中的教条、准则，高度概括出遗传信息的传递规律。
据文献记载，中心法则开篇时介绍道，“遗传物质的主要功能是控制（不一定直接）蛋白质的合成”，关注点聚焦于主要遗传物质DNA，以及最终产物蛋白质，只在“不一定直接”中表达了对RNA作用的猜测。因此随后几十年，人们先入为主地将RNA的作用理解为“跑龙套”。
在不久前，香山科学会议召开主题为“核糖核酸与生命调控及健康”的第632次学术讨论会，美国加州大学圣地亚哥分校教授付向东在会上表示，随着大量非编码RNA被发现，人们逐渐意识到RNA在生命活动中的作用被低估了，“蛋白质能干的事情，RNA基本都能干。”他连用几个“puzzle（谜）”总结RNA在生物学中的未知。
“暗黑教主”蕴藏多大暗能量？
浩瀚如海的非编码RNA仍有无数未知
2010年，《科学》杂志评选出本世纪前10年的十大科学成就。其中第一个就是“黑暗”基因组。《科学》给出的理由是，之前基因常常会得到所有的荣耀。但现在研究人员认识到，编码蛋白质的基因区域仅占整个基因组中的1.5%，而其余的基因组部分，包括长短不一的非编码核糖核酸（RNA）基因过去曾被当作“垃圾”，现在被证明它们与其他的基因同样重要。
数目巨大、种类繁多是非编码RNA的特点之一。人们至今还难以摸准它的脾气，例如，相关研究表明，相似序列的RNA，从密码结构上看可以认为是相同的，但翻译（信使RNA在细胞质里的核糖体上指导合成蛋白质的过程）的效率却大相径庭。
而无处不在则是它的另一个显著特点。这不仅体现在它大量存在于细胞内的各个细胞器中，还体现在它时刻在刷着“存在感”。它能量巨大，现已确认，非编码RNA参与了包括从干细胞维持、胚胎发育、细胞分化、凋亡、代谢、信号传导、感染以及免疫应答等几乎所有生理或病理过程的调控。
然而，从人类基因组计划提出到完成，耗时近20年，人们仅仅解密了占整个基因组1.5%的约两万个基因，虽然随着技术手段的不断进步，解密效率大幅提高，但浩瀚如海的非编码序列所扮演的“角色”，对于人类来说仍然有无数个谜团。
近年的研究表明，占人类基因组97%的非编码序列具有重要的生物学功能，且与人类的疾病相关。“但我们对这些非编码序列的了解只是‘冰山一角’。”中国科学院院士、中国科学院生物物理研究所核酸生物学重点实验室研究员陈润生表示，目前，人类对人类基因组绝大部分序列的功能还是未知状态。
近九成RNA留在核里做什么？
曾被忽略的细胞核依然是研究的“黑洞”
那么非编码RNA的真面目究竟如何呢？陈润生的团队从源头开始摸索：问题最终聚焦于中心法则指挥棒下，DNA转录为RNA后，“命运”最终走向了何方。为了对整体的遗传信息做一个梳理，他们用生物信息学方法追踪了所有RNA的去处。
研究结果表明，同样的RNA“人设”，实际存在4种“命运”。陈润生介绍，一种情况RNA是命运终点，不再发展；二是只有一小段翻译；三是按照经典的中心法则“按部就班”地翻译；四是过度翻译，就是可以对一段RNA循环翻译几个来回，形成一个蛋白质。
那么这些“命运”都出现在哪些“剧情”中呢？以RNA作为命运终结的那一支为例，陈润生团队以海拉细胞系为研究对象，发现由DNA转录为RNA后，89%的RNA并不走出细胞核。“这是出乎预料的，它们转录出来却并不走出细胞核，留在核里做什么呢？”陈润生表示，新的发现带来的是更大的未知。
细胞核中居然留存了将近九成的RNA，生命为什么会在进化中留下这样的机制？对于过去近百年始终把目光聚焦于细胞质的生命科学学者来说，细胞核中发生的一切宛如“黑洞”，目前仍无法想象。
“过去在中心法则的主导下，细胞质被认为是主要场所，而实际上囿于核中的非编码RNA的生物学作用、结构等迄今为止还远远没有破译。”陈润生说，目前学界虽然已经开始意识到非编码RNA并非“垃圾”，但相关研究方法仍是基于细胞质为主要场所，而对细胞核内的RNA是什么样的反应体系、什么样的结构还知之甚少。
超保守序列为何“亘古不变”？
非编码RNA之外或许还有更多谜题
一条长链条的非编码RNA，在一些情况下会只进行局部的翻译，生成小肽（蛋白质片段）。而大量的研究表明这个非编码RNA本身和它翻译出来的小肽，都具有明显的生物学功能，而且它们的生物学功能并不一致。
也就是说，对于生命这个超大型的机器来说，有的“小螺丝钉”表现出“一托二”甚至“一托多”的功能。
“我们在这方面也进行了梳理工作。”陈润生介绍，通过非编码RNA找到了100多个小肽，并统计这些翻译成为蛋白片段的生命活动是如何启动的。结果也出乎研究人员预料，大量的启动密码子与中心法则中的精细调控部分中提到的负责启动的密码子并不一致，但这种翻译并非随机，而是受调控的。进一步的调控研究仍在推进中。
陈润生认为，在编码区之外可能存在量级在20万左右的转录本（转录是指遗传信息从DNA转移到RNA，在RNA聚合酶的作用下形成一条与DNA碱基序列互补的信使RNA的过程。信使RNA携带遗传信息，能指导蛋白质合成。转录本则是由一条DNA通过转录形成的一种或多种成熟的信使RNA），现在充分研究的大约有三四千个左右。
“人类研究视野触及到的应该只占基因组的一半。另外一半中，也许有新的东西可能去开展新的探索。”陈润生提出未来可能的研究方向。他举例道，在生物进化的研究中，发现有200—300个碱基长度的超保守序列保守到一个碱基都不差，但它们中有一些没有任何转录RNA、也不存在于任何的调控区。这些超保守序列目前没有任何功能的线索，是什么让它们至关重要到不能够出现一丝一毫的差错和变化呢？陈润生认为，从这些无解的现象入手，可能找到突破现有理论体系的创新。
实际上，对于这些超保守序列的任何操作，包括基因敲除、基因编辑等，目前并没有证明产生哪方面的生命活动的变化。这些保守序列就如同站在智利复活节岛上的石像般展现出亘古不变的气质。
“在我们的基因组当中，在已经发现的现象之外，也许隐含着大量的不被人们轻易察觉的现象。”陈润生表示，RNA的巨大潜能是已知的未知之一，而或许还存在着组合、结构等未知的巨大机制并未进入人们的视野。
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中心法则的4个简明内容
①从DNA流向DNA（DNA自我复制）；
②从DNA流向RNA，进而流向蛋白质（转录和翻译）；
③从RNA流向RNA（RNA自我复制)；
④从RNA流向DNA（逆转录）
注：其中前两条是中心法则的主要体现，后两条是中心法则的完善和补充。
视觉中国（图）
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